1.辦公室：組織有關重要會議；起草和審核有關文件、報告及管理制度；管理審計經(jīng)費和固定資產(chǎn)；負責機關文電處理、保密、車輛管理、檔案管理、接待、安全保衛(wèi)、生活后勤保障等工作。
2.人教處：負責局機關的機構編制、人事人才工作；負責協(xié)管轄市、區(qū)審計局負責人的有關工作；負責全市審計干部教育培訓工作；負責局機關老干部工作。
3.機關黨總支：負責局機關的黨群工作（目前與人事教育處合署辦公）。
4.法制綜合處：參與財經(jīng)法規(guī)研究，草擬地方性審計法規(guī)和規(guī)章，收集和整理財經(jīng)法規(guī)，組織實施審計普法教育；負責審計復核，辦理審計聽證、審計復議和行政訴訟事項；檢查審計執(zhí)法情況，監(jiān)督社會審計組織的審計業(yè)務質(zhì)量；指導下級審計機關的法制工作。編制全市審計工作計劃和本局審計工作計劃，劃分審計范圍，協(xié)調(diào)審計業(yè)務事項，檢查計劃執(zhí)行情況；負責全市審計調(diào)研、審計宣傳、審計信息、審計統(tǒng)計工作，分析審計成果，建立審計對象和審計成果臺賬；負責全市審計業(yè)務質(zhì)量管理和審計業(yè)務綜合考核工作。
5.財政金融審計處：擬定市級預算執(zhí)行情況的審計總體方案，匯總審計結果；負責審計市財政局組織預算執(zhí)行情況，市金庫辦理預算資金的收納撥付情況；受省審計廳委托負責審計市地稅局系統(tǒng)的稅收征管情況和財政財務收支情況；負責審計本市所轄市、區(qū)人民政府預算執(zhí)行情況和決算；負責審計市財政局及其所屬單位的財政財務收支情況；負責審計市屬金融機構及所屬企事業(yè)單位的資產(chǎn)、負債、損益情況；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；根據(jù)審計署的安排，組織全市審計機關審計中央在常州的金融機構的資產(chǎn)、負債、損益情況；開展財政金融專項審計及審計調(diào)查；指導下級審計機關的財政金融審計業(yè)務。
6.行政事業(yè)審計處：負責審計與市財政有撥繳款關系的市人大機關、市政協(xié)機關、市級司法機關、政黨組織、社會團體的財政財務收支；負責審計市政府有關部門及其所屬企事業(yè)單位的財政財務收支；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；根據(jù)省審計廳的安排，開展全市工商、質(zhì)量技術監(jiān)督等部門財政財務收支審計；組織行政事業(yè)專項審計和審計調(diào)查；指導下級審計機關行政事業(yè)審計業(yè)務。
7.經(jīng)貿(mào)審計處：負責審計市政府有關部門及其直屬機構的財政財務收支；負責審計市政府授權的國有資產(chǎn)經(jīng)營公司、國有資產(chǎn)管理公司、控股公司、集團公司資產(chǎn)、負債、損益情況；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；組織經(jīng)貿(mào)專項審計和審計調(diào)查；指導下級審計機關經(jīng)貿(mào)審計業(yè)務。
8.社會保障審計處：負責審計市政府有關部門及其所屬企事業(yè)單位的財政財務收支和資金使用效益；負責審計市級人民政府管理的社會保障資金的籌集、管理、使用情況；開展社會保障專項審計和審計調(diào)查；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；指導下級審計機關社會保障審計業(yè)務。
9.固定資產(chǎn)投資審計處：負責管理、協(xié)調(diào)、監(jiān)督市級國家建設項目的審計業(yè)務，負責審計市政府有關部門及其所屬企事業(yè)單位的財政財務收支；對市屬施工企業(yè)和房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)的資產(chǎn)、負債和損益情況進行審計監(jiān)督；組織固定資產(chǎn)投資專項審計和審計調(diào)查；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；指導下級審計機關的固定資產(chǎn)投資審計業(yè)務。
10.農(nóng)業(yè)與水利、環(huán)保審計處：負責審計市政府有關部門及其所屬企事業(yè)單位的財政財務收支和資金使用效益；負責審計市級人民政府管理的農(nóng)業(yè)與水利、環(huán)保資金的籌集、管理、使用情況；開展農(nóng)業(yè)與水利、環(huán)保審計和審計調(diào)查；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；指導下級審計機關農(nóng)業(yè)與水利、環(huán)保審計業(yè)務。
11.外資審計處：負責市本級中外合資、合作企業(yè)和境外企業(yè)審計；負責審計國際組織和外國政府對我市提供的貸款、援助和贈款項目的財政收支；提供世界銀行和亞洲開發(fā)銀行援貸款項目的審計公證報告；開展外資運用專項審計和審計調(diào)查；開展經(jīng)濟責任審計；協(xié)助開展經(jīng)濟案件審計；指導下級審計機關外資運用審計業(yè)務。
12.經(jīng)濟責任審計與內(nèi)部審計指導處：負責并協(xié)調(diào)黨政領導干部和企業(yè)領導人員的任期經(jīng)濟責任審計工作；指導全市黨政領導干部、企業(yè)領導人員任期經(jīng)濟責任審計和經(jīng)濟案件審計業(yè)務；負責并協(xié)調(diào)市委、市政府交辦的經(jīng)濟案件審計工作；對全市內(nèi)部審計工作進行指導、監(jiān)督；指導下級審計機關經(jīng)濟責任審計、經(jīng)濟案件審計和內(nèi)部審計管理工作。
13.計算機審計處：負責并指導被審計單位的會計電算化軟件審計；負責全市審計機關計算機輔助審計系統(tǒng)、審計管理系統(tǒng)、辦公自動化系統(tǒng)的規(guī)劃與管理；組織全市審計機關計算機審計軟件的培訓、推廣和運用；承擔市審計機關計算機審計方面的其它工作；指導下級審計機關的計算機審計工作。
14.審計業(yè)務監(jiān)督處：負責審計業(yè)務的全程質(zhì)量監(jiān)督，促進審計執(zhí)法行為規(guī)范；監(jiān)督審計決定的執(zhí)行，促進審計建議的落實和整改；監(jiān)督審計紀律的執(zhí)行，維護審計形象；開展對中介機構和參加審計中介人員的審計質(zhì)量監(jiān)督；配合監(jiān)察室對國家審計人員違紀事項或行為進行查處，配合法制綜合處對中介機構及參與審計人員違紀問題進行查處等。
15.按有關規(guī)定設置紀檢監(jiān)察機構。
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